تشمل جامعة بدر 16 كلية، ويحق للطالب التقديم فيها إذا كان حاصل على التنسيق الداخلي للجامعة، والذي يختلف تمامًا عن تنسيق الثانوية العامة، فكل كلية ويكون لها تنسيق مختلف،